免疫治療副作用預測： 腸道菌群

免疫檢驗點阻斷治療可以活化免疫系統靶向至腫瘤在近來的臨床試驗中顯示出很大潛力。然而，這些治療方案在某些病人身上能夠引起危險的副作用。臨床醫生一個重要的目標就是能夠鑒別出具有有害副作用風險的病人。Pamer 和 Wolchok 領導的一項研究現在表明，腸道菌群的構成能夠預測病人在接受 CTLA4 阻斷抗體 ipilimumab 治療后是否會發展腸炎。

研究者獲得了34個轉移性黑色素瘤病人的糞便樣本，並將病人根據 ipilimumab 治療后是否患有腸炎分為兩組。通過16S rRNA測序獲得糞便樣本中的微生物譜，揭示兩組病人在 ipilimumab 介導的腸炎發病前具有相似的微生物丰度。然而，不患腸炎的病人有更大比例的擬桿菌，尤其是 Bacteroidaceae, Rikenellaceae and Barnesiellaceae 這三個菌屬的。

鳥槍法測序可以鑒定出與腸炎抗性相關的特定的微生物遺傳途徑。研究者獲得了102種微生物模塊，發現其中與多胺轉運和B族維生素生物合成相關的四個微生物模塊大量存在於腸炎抗性病人腸道菌群中。最終他們驗證是否這些微生物模塊能夠被用來預測 ipilimumab 治療后腸炎發病情況。

利用基於102種微生物模塊的遞歸演算法預測敏感性可達70%，特異性達100%（只有三個病人被錯誤地分類為腸炎抗性）。利用基於四種微生物模塊的分析，敏感性可達70%特異性為83%。這表明這四種微生物模塊能作為判斷病人經過ipiliumab治療后是否會患腸炎的潛在生物指標。

近期的研究也已經表明腸道菌群能夠影響癌症免疫治療療效，本文的研究則表明腸道菌群可以幫助判斷治療方法的副作用，這對於治療安全性的研究有重要推動意義。

參考文獻：Dubin, K. et al. Intestinal microbiome analyses identify melanoma patients at risk for checkpoint-blockade-induced colitis. Nature Commun. 7, 10391 (2016)