中西醫之爭由來已久，歷史上有好幾次廢除中醫的呼聲。詳見，真的要廢除中醫么？

然而說中醫就是偽科學，西醫就是科學這對么？

中醫一般指以中國漢族勞動人民創造的傳統醫學為主的醫學，所以也稱漢醫（還有苗醫、蒙醫、藏醫等等），是研究人體生理、病理以及疾病的診斷和防治等的一門學科；

西醫一般認為是近代時期的西方國家的學者們在摒棄古代西醫之後，在物理學、化學、生物學、解剖學基礎上發展出來了一門全新的醫學體系，而且這門醫學體系就是當今國人常說的「西醫」。

那麼這裡就有一個問題了，古代的西醫去哪了？古代西醫科學么？

西方古代的「四體液」之說，與中醫的「陰陽五行」很相似。起初希臘醫學認為人有三種體液：血液、膽汁和黏液。但為了和四元素說配合，就只好將膽汁分為黃膽汁和黑膽汁。這和中醫為了把四季和五行湊合，勉強自夏季分出仲夏出來，有異曲同工之妙。但這種四分法也非全憑空杜撰，而是有點科學原理的，例如：水有冷濕的特性，土則有乾冷的特性。而外傷會流血，嘔吐會吐黃膽汁，消化道出血會解黑便（也許就是黑膽汁），感冒就會流黏黏的鼻水。可以看出古代西醫和古代中醫是差不離的。

隨著人類認識世界的不斷加深，對微觀世界的不斷探索，其他學科包括物理學、化學、生物學的不斷發展，（個人認為主要歸功於文藝復興和工業革命），古代西醫逐漸被拋棄，而現代西醫日益興盛。與此同時，傳統中醫（漢醫）發展受到意思形態的約束，受限於微觀結構的視界，中醫在治療技術上逐步落後於西醫的發展，主要體現在外科手術治療，急診治療方面。

古代西醫已經被拋棄，而中醫或者說漢醫依然活躍於人們的生活中，包括中醫治療尿失禁，丹參滴丸在美國進行臨床試驗等待FDA批准等等。更值得指出的是，中醫的理念已經深入中國人（漢人）的骨子裡，無論是醫生還是病人都會有意無意提出中醫的概率。最明顯的一個就是「上火」，要知道現代西醫可是沒有上火一說。

樊代明院士曾經提出個一個觀點：「醫學不是科學，一因國人通常把「科學」二字當真理來解，說醫學不是科學，就似醫學不是真理，而是謬論，甚則邪說；二因醫學中包含了大量科學或科學的元素，它不是純粹的科學，也不是單純的哲學，還涵蓋有社會學、人類學、藝術學、心理學等。我們必須用正確的態度來對待醫學與科學的相關關係，也必須用正確的態度對待從事醫學的人。我們可用科學的理論幫扶醫學，但不能用之束縛醫學；我們可用科學的方法研究醫學，但不能用之誤解醫學；我們可用科學的數據或技術助診疾病，但不能用之取代醫生；我們可用科學的共識形成指南，但不能用之以偏概全。」深以為然。

醫學比科學起源早，是醫學的積累、進步以及需求催生了科學。中醫和西醫的不同只不過是在認識世界的角度和方法上有所區別，都是通過長期大量不間斷的理論探索和實踐檢驗，最終形成最大可能的適合人體保健、康復和各種疾病診療的知識體系，都是在探索如何讓人類健康的活得更久，這是毫無差別的。