乙醯酯酶和丁醯酯酶抑製劑的設計、合成、分子對接研究和活性評價

阿爾茨海默病(AD)是一種常見的中樞神經系統退行性疾病。已有研究結果顯示,適當比例地同時抑制乙醯膽鹼酯酶(AChE)和丁醯膽鹼酯酶(BuChE是更加理想的AD治療方案)。

1.化合物設計

A.前期調研

根據已經批准的AChE和BuChE抑製劑,很容易發現共同的活性骨架,同時該骨架已經得到實驗證明為很好的活性骨架,具有多方面的抑制活性。

批准的AChE和BuChE抑製劑

B.化合物設計

設計策略

2.化合物合成

設計化合物的合成路線

3.分子對接研究

為了發現設計化合物和靶點的相互作用模式,進行分子對接研究。

① 利用Openbabel將設計化合物有2D轉換為3D格式;

② 利用Autodock Tools準備對接需要的受體和配體文件;

Advertisements

③ 利用Autodock Vina進行對接;

④ 利用Chimera可視化蛋白配體複合物對接結果,分析各種參數並繪圖。

化合物7f和TcAChE相互作用圖

4.活性評估

實驗測得AChE和BuChE的IC50(nM)

5.結論

新設計合成的化合物進行AChE和BuChE抑制活性評價,大多數新化合物顯出對AChE很強的抑制活性,其中7f(IC50=5nM)是活性最好的化合物。對接研究也顯示出配體(7f)在活性位點與受體形成π-π和氫鍵相互作用。四氫氨基喹啉(tetrahydroaminoquinoline)和香豆素(coumarin)骨架可作為有潛力的先導化合物結構,進行進一步改造優化。

主要分子模擬軟體與技術:

Advertisements

Autodock Tools(學術免費)

Autodock Vina(學術免費)

Chimera(學術免費)

Openbabel(學術免費)

Advertisements

你可能會喜歡