新方法有效鑒定癌症相關基因突變!

科學家已經確定了數以千計的之前被忽視的(儘管罕見)可能有助於癌症生長的遺傳突變。這些在PLOS計算生物學雜誌上發表的研究結果可以幫助為研發新藥鋪路。

當細胞中的遺傳突變導致腫瘤的異常生長時,出現癌症。一些癌症藥物通過靶向針對一般形式的突變蛋白質(因為編碼它們的基因發生突變)來攻擊腫瘤細胞。然而,目前僅已確定了一小部分對癌症有顯著促進作用的突變。

馬里蘭大學的托馬斯·彼得森及其同事開發了一種新的統計分析方法,其使用癌症患者的遺傳數據來發現致癌突變。與以前關注個別基因突變的研究不同,新方法解決了相關蛋白家族共享的類似突變。

具體來說,新方法重點集中在被稱為蛋白質結構域的蛋白質的亞組分中的突變上。即使不同的基因編碼它們,不同的蛋白質可以共享共同的蛋白質結構域。該新策略利用蛋白質結構域和功能的現有知識來確定蛋白質結構域內位置更突出的腫瘤。

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使用這種新方法,研究人員確定了數千種罕見的腫瘤突變發生在與其他腫瘤的其他蛋白質中發現的突變相同的結構域位置——暗示著它們可能參與癌症的發生。

MaricelKann研究的資深作者說:「也許只有兩名患者在特定蛋白質中有突變,但是當你意識到這一區域與癌症患者其他蛋白質的突變位置完全相同時,你就意識到重要的是研究這兩個突變。

研究人員已經提出術語「oncodomain」是指更可能含有致癌突變的蛋白質結構域。Oncodomains的進一步研究可以幫助藥物開發:「因為這麼多蛋白質的結構域是相同的,」Kann說,「單次治療可能會解決廣泛的突變型蛋白質引起的癌症。」(sunshine2015205036)

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