中醫學基礎理論
古典基礎理論
中醫理論來源於對醫療經驗的總結及中國古代的陰陽五行思想。其內容包括精氣學說、陰陽五行學說、氣血津液、藏象、經絡、體質、病因、發病、病機、治則、養生等。早在兩千多年前，中醫專著《黃帝內經》問世，奠定了中醫學的基礎。時至今日，中國傳統醫學相關的理論、診斷法、治療方法等，均可在此書中找到根源。
中醫具有完整的理論體系，其獨特之處，在於「天人合一」、「天人相應」的整體觀及辨證論治。主要特點有：認為人是自然界的一個組成部分，由陰陽兩大類物質構成，陰陽二氣相互對立而又相互依存，並時刻都在運動與變化之中。在正常生理狀態下，兩者處於一種動態的平衡之中，一旦這種動態平衡受到破壞，即呈現為病理狀態。而在治療疾病，糾正陰陽失衡時並非採取孤立靜止的看問題方法，多從動態的角度出發，即強調「恆動觀」。
認為人與自然界是一個統一的整體，即「天人合一」、「天人相應」。人的生命活動規律以及疾病的發生等都與自然界的各種變化（如季節氣候、地區方域、晝夜晨昏等）息息相關，人們所處的自然環境不同及人對自然環境的適應程度不同，其體質特徵和發病規律亦有所區別。因此在診斷、治療同一種疾病時，多注重因時、因地、因人制宜，並非千篇一律。
認為人體各個組織、器官共處於一個統一體中，不論在生理上還是在病理上都是互相聯繫、互相影響的。因而從不孤立地看待某一生理或病理現象，頭痛醫頭，腳痛醫腳，而多從整體的角度來對待疾病的治療與預防，特彆強調「整體觀」。
精氣學說
氣是構成天地萬物的原始物質。
氣的運動稱為「氣機」，有「升降出入」四種形式。由運動而產生的各種變化，稱為「氣化」，如動物的「生長壯老已」，植物的「生長化收藏」。
氣是天地萬物之間的中介，使之得以交感相應。如：「人與天地相參，與日月相應」。天地之精氣化生為人。
陰陽學說
陰陽是宇宙中相互關聯的事物或現象對立雙方屬性的概括。最初是指日光的向背，向日光為陽，背日光為陰。
陰陽的交互作用包括：陰陽互生、陰陽交感、對立制約、互根互用、消長平衡、相互轉化。
五行學說
五行生剋
五行學說是中國古代哲學的重要成就，五行即木、火、土、金、水，但是這並不代表五種物質，而是五種屬性。
五行於中醫則體現了具備這五種屬性的人體五大系統的相互關係。木火土金水這五個符號分別代表肝心脾肺腎所統領的五大系統。中醫不是研究微觀的病毒細菌如何作用於人體的理論而是研究人體整體的各個系統之間的關係，並且通過中藥，按摩，針灸，甚至心理作用去調節各個系統之間的平衡，以此保持身體健康。
五行的交互作用包括：相生、相剋、制化、勝復、相侮、相乘、母子相及。
藏象學說
藏：指人體內的五臟六腑、奇恆之府，通稱為臟腑。象：一指「形象」，即臟腑的解剖型態；二指「徵象」，即臟腑表現於外的生理病理；三指「應像」，即臟腑相應於四時陰陽之象。
透過外在「象」的變化，以測知內在「藏」的生理病理狀態，稱為「從象測藏」。即「視其外應，以知其內臟」。
「臟腑」不單是解剖型態的概念，而是包括解剖、生理、病理在內的綜合概念。
五臟：指肝、心、脾、肺、腎，一般籠統功能為「化生和儲藏精氣」。
六腑：指膽、胃、大腸、小腸、膀胱、三焦，一般籠統功能為「腐熟水榖、分清泌濁、傳化糟粕」。
奇恆之府：指「腦、髓、骨、脈、膽、女子胞」。
氣血津液
氣、血、津液是構成和維持人體生命活動的基本物質氣的生成源自先天與後天。稟受於父母的精氣，稱為「先天之氣」。肺吸入自然的清氣，與脾胃運化水榖產生的水榖之氣，合稱為「後天之氣」。氣有推動、溫煦、防禦、固攝、氣化、營養等作用。人體的氣可分為元氣、宗氣、營氣、衛氣、臟腑之氣、經絡之氣。氣的「升降出入」運動失常，稱為「氣機不調」。其表現形式有氣滯、氣鬱、氣逆、氣陷、氣脫、氣閉等。
經絡學說
參見：針灸學及腧穴經絡是人體運行氣血、聯絡臟腑形體官竅、溝
《本草綱目》
通上下內外的通道。經絡系統包括十二經脈、十二經別、奇經八脈、十五別絡、浮絡、孫絡、十二經筋、十二皮部等。經絡在中醫學的重要性正如《扁鵲心書》所說：「學醫不知經絡，開口動手便錯。蓋經絡不明，無以識病證之根源，究陰陽之傳變。」
病因學說
《黃帝內經》將病因分為陰陽兩類：「生於陽者，得之風雨寒暑」，「生於陰者，得之飲食、居處、陰陽、喜怒」。漢代張仲景在《金匱要略》中，把病因分為三類：「經絡受邪入臟腑，為內所因」，「四肢九竅，血脈相傳，壅塞不通，為外皮膚所中」，「房室、金刃、蟲獸所傷」。宋代陳無擇提出「三因學說」：外所因、內所因、不內外因。近代則將病因分為五類：外感病因：包括六淫（風寒暑濕燥火）和癘氣。內傷病因：包括七情（喜怒憂思悲恐驚）、飲食失宜、勞逸失度。繼發病因：包括痰飲、瘀血、結石。其他病因：包括外傷、寄生蟲、胎傳、諸毒、醫過。
現代中醫基礎
上世紀90年代發起的現代中醫基礎理論的原始創新、革命。
中醫新哲學觀
中醫三個哲學觀：整體觀、辯證觀，及新挖掘出的中醫第三哲學觀：相似觀－分形論。現代氣本質氣是『信息－能量－物質』的統一體廣義波。分形分維經絡分形分維的經絡
扁鵲
解剖結構，非平滑，非管，粗糙，細胞充填的'自身調節-體液-神經'分形經絡模型。分形經絡的分形維數中醫分形集分形陰陽集分形幾何中最簡單的二分陰陽分形集的分形維數五行分形集自相似、多層次的五行分形集的分形維數數理陰陽陰陽的數理定量分形藏象五系統五臟六腑的分形維數 分形藏象五系統－暨心繫統、肝系統、脾系統、肺系統、腎系統
理論有理
三元理論認為：「疾病萬千，不離三元。何謂三元？毒郁虛」。
三元醫學理論認識疾病，認為世界的萬千疾病的病因、病機、辯證、治療，不離三個字：「毒郁虛」。
毒就是有熱了，上火了，血熱了，濕熱，傷風、傷寒了。有菌性炎症、無菌性炎症，造成身體的腫脹、滲出、疼痛和器官損害壞死變性的改變。
郁就是身體的各種不流行、不通暢、即郁滯不通。包括氣、血、痰、濕、食、水在體內造成的不暢或堵塞。氣滯則脹，血滯則青或疼痛，痰阻則難咯或出現神志病變，濕盛則沉重，食積則不消，或大便艱。水停則脹如腹水。
虛就是不足，即氣血陰陽的不足。氣虛無力，血虛則無華色，陽虛則外寒，陰虛則內熱。
世界的萬千疾病，有毒了，不通了，虛弱不足了，除此三者，沒有別的病。無毒無虛腑臟經絡通暢，則無病。這就是武學文中醫主任醫師的「三元醫學理論」。
人是一個有機的整體，人和自然有著密切的關係。這就是醫學的整體觀念，治病時辨證論治，要分清毒郁虛，提綱挈領地認識疾病。整個自然界是一元，一元產生陰陽二氣（即自然界相互對立又依存著的兩種屬性，並且在一定條件下可以互相轉化）。從陰陽的二元論到毒郁虛的三元論，才更適合指導疾病的診斷和治療。三元論能統領疾病的各種辨證方法（陰陽辨證、臟腑辨證、氣血津液辨證、八綱辨證、經絡辨證、六經辨證、衛氣營血辨證、三焦辨證等。）任何以一種辨證方法和其它辨證方法割裂開來，或者以一種經典理論（如六經辨證）來限制和阻止其它醫學理論的發展，都是非常錯誤和不得人心的。
三元醫學理論的毒郁虛之間，也存在不可分割的辨證關係。也不能把毒郁虛完全割裂開來。即毒中有郁有虛，郁中也有毒有虛，虛中也可以有毒有郁。即你中有我，我中有你，或者三中有一，或者三中有二，才能完整系統的認識疾病。